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| Registros recuperados : 22 | |
| 3. |  | ANDRADE, A. C.; VIEIRA, L. G. E.; COLOMBO, C. A.; PEREIRA, G. A. G. Coffee functional genomics in Brazil. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON COFFEE SCIENCE, 21., 2006, Montpellier, France. Table of contents... Montpellier, France: Association for Science and Information on Coffee, 2006.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 4. | | ANDRADE, A. C.; VIEIRA, L. G. E.; COLOMBO, C. A.; PEREIRA, G. A. G. Coffee functional genomics in Brazil. INTERNATIONAL CONFERENCE ON COFFEE SCIENCE, 21., 2006, Montpellier, France. Table of contents... Montpellier, France: Association for Science and Information on Coffee, 2006.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 5. | | MALUF, M. P.; SILVESTRINI, M.; RUGGIERO, L. M. de C.; GUERREIRO FILHO, O.; COLOMBO, C. A. Genetic diversity of cultivated Coffea arabica inbred lines assessed by RAPD, AFLP and SSR marker systems. Scientia Agricola, v. 62, n. 4, p. 366-373, 2005. Título em português: Caracterização da diversidade genética de linhagens comerciais de Coffea arabica através de marcadores moleculares do tipo RAPD, AFLP e SSR.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 6. | | SILVESTRINI, M.; MALUF, M. P.; RUGGIERO, L. M. de C.; GUERREIRO-FILHO, O.; COLOMBO, C. A. Caracterização de linhagens comerciais de café através de marcadores moleculares. IN: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 1., 2000, Poços de Caldas. Resumos Expandidos. Brasília, DF: Embrapa Café/MINASPLAN, 2000.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 7. | | NOBILE, P. M.; QUECINI, V.; BAZZO, B.; QUITERIO, G.; MAZZAFERA, P.; COLOMBO, C. A. Transcriptional profile of genes involved in the byosynthesis of phytate and ferritin in coffea. Journal of Agricultural and Food Chemistry, Washington DC, v. 58, n. 6, p. 3479-3487, mar. 2010.| Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho. |
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| 10. | | CHIORATO, A. F.; CARBONELL, S. A. M.; COLOMBO, C. A.; DIAS, L. A. dos S.; ITO, M. F. Genetic diversity of common bean accessions to the germplasm bank of the Insituto Agronômico - IAC. Crop Breeding and Applied Biotechnology, Viçosa, MG, v. 5, n. 1, p. 1-9, Mar. 2005.| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 11. | | VENANCIO, M. M. H.; KIIHL, T. A. M.; SIMON, R. de A.; PUTTINI, F. de A.; NICOMEDES JÚNIOR, J.; COLOMBO, C. A. Caracterização agro-morfológica de acessos elite de mamona (Ricinus communis) do banco de germoplasma do Instituto Agronômico de Campinas. CONGRESSO BRASILEIRO DE MAMONA, 5.; SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE OLEAGINOSAS ENERGÉTICAS, 2.; FÓRUM CAPIXABA DE PINHÃO-MANSO, 1., 2012, Guarapari. Desafios e Oportunidades: anais. Campina Grande: Embrapa Algodão, 2012. p. 356| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 12. | | SAWAZAKI, H. E.; SÁ, L. A. N. de; ALCÂNTARA, M. Q.; POLEZ, V. L. P.; GONÇALVES, C. R. N. C. B.; VEIGA, R. F. A.; COLOMBO, C. A. Otimização da diagnose molecular de vírus, bactéria e fungo em cana-de-açúcar. Biológico, São Paulo, v. 73, n. 2, p. 282-287, 2011. Anais da 24ª Reunião Anual do Instituto Biológico, São Paulo, nov. 2011.| Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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| 13. | | SAWAZAKI, H. E.; SA, L. A. N. de; GONÇALVES, C. R. N. C. B.; VEIGA, R. F. A.; COLOMBO, C. A. Molecular diagnosis optimization of virus, bacteria and fungi in sugarcane. Internacional Research Journal of Plant Science, Sapele, v. 4, n. 3, p. 76-83, 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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| 14. | | VILELLA, O. T.; LANNES, S. D.; POT, D.; FERREIRA, L. P.; PRIOLLI, R. H. G.; RAMOS, L. C. S.; COLOMBO, C. A.; VIEIRA, L. G. E. Obtenção de marcadores moleculares por meio de PCR-RFLP de genes relacionados com qualidade em café. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 6., 2009, Vitória. Resumos expandidos. Brasília, DF: Embrapa Café.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| 15. | | ZUCCHI, M. I.; PINHEIRO, J. B.; VELLO, N. A.; OLIVEIRA, E. J. de; ARIAS, C. A. A.; PRIOLLI, R. H. G.; MOLLER, M.; COLOMBO, C. A. Uso de marcadores microssatélites na caracterização de cultivares brasileiras de soja. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 3., 2005, Gramado. Anais... Passo Fundo: Embrapa Trigo; Sociedade Brasileira de Melhoramento de Plantas, 2005. 1 CD-ROM. Seção: Área 1 - Espécies Anuais - Resumos: Pdf.1645. Editado por Ana Christina Sagebin Albuquerque, Cláudia de Mori, Edson Iorczeski, João Carlos Haas, Paulo Fernando Bertagnolli.| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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| 16. | | VIDAL, R. O.; MONDEGO, J. M. C.; POT, D.; AMBRÓSIO, A. B.; ANDRADE, A. C.; PEREIRA, L. F. P.; COLOMBO, C. A.; VIEIRA, L. G. E.; CARAZZOLLE, M. F.; PEREIRA, G. A. G. A high-throughput data mining of single nucleotide polymorphisms in Coffea species expresed sequence tags suggests differential homeologous gene expression in the allotetrapoloid Coffea arabica. PLANT PHYSIOLOGY, v. 154, p. 1053-1066. 2010. 1053-1066| Biblioteca(s): Embrapa Café; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Unidades Centrais. |
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| 17. | | CARVALHO, V. C.; SAWAZAKI, H. E.; GONÇALVES, C. R. N. C. B.; SENGER, M. M. M.; SA, L. A. N. de; VEGA, R. F. A.; ALCÂNTARA, M. Q.; COLOMBO, C. A. Análises moleculares de bactérias e fungo em cana-de-açúcar. In: CONGRESSO INTERINSTITUCIONAL DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 4., 2010, Campinas. Anais... Campinas: IAC: ITAL: APTA; Jaguariúna: Embrapa Meio Ambiente, 2010. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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| 18. | | PERSEGUINI, J. M. C. K.; CHIORATTO, A. F.; ZUCCHI, M. I.; COLOMBO, C. A.; CARBONELL, S. A. M.; MONDEGO, J. M. C.; GAZAFFI, R.; GARCIA, A. A. F.; CAMPOS, T. de; SOUZA, A. P. de; RUBIANO, L. B. Genetic diversity in cultivated carioca common beans based on molecular marker analysis. Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 34, n. 1, p. 88-102, 2011.| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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| 19. | | MONDEGO, J. M. C.; VIDAL, R. O.; CARAZZOLLE, M. F.; TOKUDA, E. K.; PARIZZI, L. P.; COSTA, G. G. L.; PEREIRA, L. F. P.; ANDRADE, A. C.; COLOMBO, C. A.; VIEIRA, L. G. E.; PEREIRA, G. A. G. An EST-based analysis identifies new genes and reveals distinctive gene expression features of Coffea arabica and Coffea canephora. BMC Plant Biology, v.11, n. 30, 2011.| Biblioteca(s): Embrapa Café; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 20. | | COLOMBO, C. A.; YAMAMOTO, P. Y.; RAMOS, L. C. S.; MAZZAFERA, P.; GALLO, P. B.; VILELLA, O. T.; LANNES, S. D.; POT, D.; FERREIRA, L. P.; VIEIRA, L. G. E.; PEREIRA, L. F. P. Novos marcadores para fins de mapeamento e localização de QTLs a partir de PCR-RFLP de genes de genoma café brasileiro. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 6., 2009, Vitória. Inovação científica, competitividade e mudanças climáticas : anais. Vitória: Consórcio Pesquisa Café, 2009.| Biblioteca(s): Embrapa Café. |
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| Registros recuperados : 22 | |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Meio Ambiente. |
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Data corrente: |
01/08/2013 |
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Data da última atualização: |
02/08/2013 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
C - 0 |
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Autoria: |
SAWAZAKI, H. E.; SA, L. A. N. de; GONÇALVES, C. R. N. C. B.; VEIGA, R. F. A.; COLOMBO, C. A. |
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Afiliação: |
HAIKO ENOK SAWAZAKI, IAC; LUIZ ALEXANDRE NOGUEIRA DE SA, CNPMA; CASSIARA REGINA NOVENTA CORREA BARBOSA GONÇALVES, CTC; RENATO FERRAS DE ARRUDA VEIGA, IAC; CARLOS AUGUSTO COLOMBO, IAC. |
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Título: |
Molecular diagnosis optimization of virus, bacteria and fungi in sugarcane. |
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Ano de publicação: |
2013 |
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Fonte/Imprenta: |
Internacional Research Journal of Plant Science, Sapele, v. 4, n. 3, p. 76-83, 2013. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract: Aiming at optimizing the diagnosis of major sugarcane diseases by PCR, primers were developed (scald, orange rust) and amplified fragments according to the literature were used as positive control, such as those caused by: 1 - Bacteria, (ratoon stunting and leaf scald) 2 - Viruses, (yellow leaf, mosaic, mosaic streak and fijivirus) 3-Fungus, (smut, orange rust and curvularia). For diseases with long latency period (leaf scald, ratoon stunting, yellow leaf, mosaic, fijivirus, smut and orange rust), primers were designed for real time PCR. For testing, infected leaves, fungal colonies, amplified DNA fragment or 40 seedlings were used. Real time PCR analyses have enabled the detection of sugarcane samples with highest dilution of DNA. The pair of primers designed for orange rust was more specific. The pair of primers designed for scald, apparently was not able to distinguish only bacteria of the genus Erwinia, whereas the primers described in the literature were observed amplify others genera, such as Xanthomonas, Pseudomonas, Erwinia, Stenotrophomona and Pantoea. The three strains of the fungus curvularia, found in sugarcane, resembled more to the species C.cymbopogonis, C.geniculata, C.sp. Of the 28 primer pairs tested, the best were shown for each of the disease-causing agent. |
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Palavras-Chave: |
Leaf scald; PCR. |
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Thesagro: |
Bactéria; Cana de açúcar; Diagnóstico; Doença de planta; Escaldadura; Ferrugem alaranjada; Fungo; Vírus. |
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Thesaurus NAL: |
Curvularia; Fijivirus; Plant diseases and disorders; Polymerase chain reaction; Ratoon stunting disease; Rust diseases; Scald diseases; Smut diseases; Sugarcane; Sugarcane streak virus; Sugarcane yellow leaf virus. |
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Categoria do assunto: |
H Saúde e Patologia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/86855/1/2013AP16.pdf
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Marc: |
LEADER 02511naa a2200421 a 4500
001 1963146
005 2013-08-02
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100 1 $aSAWAZAKI, H. E.
245 $aMolecular diagnosis optimization of virus, bacteria and fungi in sugarcane.$h[electronic resource]
260 $c2013
520 $aAbstract: Aiming at optimizing the diagnosis of major sugarcane diseases by PCR, primers were developed (scald, orange rust) and amplified fragments according to the literature were used as positive control, such as those caused by: 1 - Bacteria, (ratoon stunting and leaf scald) 2 - Viruses, (yellow leaf, mosaic, mosaic streak and fijivirus) 3-Fungus, (smut, orange rust and curvularia). For diseases with long latency period (leaf scald, ratoon stunting, yellow leaf, mosaic, fijivirus, smut and orange rust), primers were designed for real time PCR. For testing, infected leaves, fungal colonies, amplified DNA fragment or 40 seedlings were used. Real time PCR analyses have enabled the detection of sugarcane samples with highest dilution of DNA. The pair of primers designed for orange rust was more specific. The pair of primers designed for scald, apparently was not able to distinguish only bacteria of the genus Erwinia, whereas the primers described in the literature were observed amplify others genera, such as Xanthomonas, Pseudomonas, Erwinia, Stenotrophomona and Pantoea. The three strains of the fungus curvularia, found in sugarcane, resembled more to the species C.cymbopogonis, C.geniculata, C.sp. Of the 28 primer pairs tested, the best were shown for each of the disease-causing agent.
650 $aCurvularia
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650 $aPolymerase chain reaction
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700 1 $aCOLOMBO, C. A.
773 $tInternacional Research Journal of Plant Science, Sapele$gv. 4, n. 3, p. 76-83, 2013.
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Registro original: |
Embrapa Meio Ambiente (CNPMA) |
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